《植物生理学报》 2020, 56(2): 265-274

基于番红花转录组的碳氮代谢基因挖掘

周琳, 杨柳燕, 蔡友铭, 王桢, 张永春*

上海市农业科学院林木果树研究所, 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海201403

通信作者：张永春；E-mail: saasflower@163.com

摘　要：

番红花球茎是其开花和新球茎形成的基础, 促进番红花种球中营养物质积累、提高番红花繁殖效率是解决国内番红花产量供不应求的有效途径, 而番红花种球生长和繁殖与生长发育期间碳氮代谢途径密切相关,深入研究番红花生长发育机理, 尤其是碳氮代谢途径是番红花栽培和繁育体系优化的前提。通过对番红花已有转录组数据进行从头组装, 得到62 105条unigene序列。注释结果表明, 仅有55.89%序列能够注释到公共数据库, 注释到GO分类和KEGG注释的unigene分别为36 661和14 185条。通过生物信息学分析, 挖掘番红花多个参与碳氮代谢的重要基因和转录因子, 包含了蔗糖合成酶基因、蔗糖磷酸合成酶基因、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因、谷氨酸合成酶基因和碳酸酐酶基因等, 以及转录因子GATA和DOF。研究结果可为番红花生长发育功能基因的发掘与利用研究提供参考。

关键词：番红花; 转录组; 碳氮代谢; 生物信息学分析

收稿：2019-08-08   修定：2019-12-18

资助：上海市现代农业产业技术体系(沪农科产字2019第8号)和上海市科技兴农成果转化项目(沪农科转字2016第2-4号)。